Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SYN1P17600 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYN1P17600 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYN1P17600 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms