Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
KNCNA6PVL3 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms