Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHPF2Q9P2E5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms