Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
GTSF1Q8WW33 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
GTSF1Q8WW33 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms