Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SEMA6DQ8NFY4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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