Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CLIP4Q8N3C7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CLIP4Q8N3C7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms