Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CSPP1Q1MSJ5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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