Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATP2B3Q16720 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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