Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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