Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 KLK2-201ENST00000325321 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZNF549-201ENST00000240719 3969 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZNF766-202ENST00000593612 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 FCRL2-201ENST00000361516 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TNFSF10-202ENST00000420541 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CASZ1-201ENST00000344008 4405 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 LINC00667-205ENST00000582008 3979 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TKTL1-202ENST00000369915 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CYP1A1-202ENST00000395048 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 BCL2L11-218ENST00000615946 5026 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 BCL2L11-220ENST00000620862 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RPGRIP1-213ENST00000557771 3870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZNF133-215ENST00000630056 1999 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms