Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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FOXF2Q12947 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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FOXF2Q12947 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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