Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAMSAP2Q08AD1 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms