Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms