Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms