Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CACNA2D1P54289 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA2D1P54289 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms