Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFSF9P41273 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms