Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 COL8A1-202ENST00000273342 3029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TGFBR1P36897 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TGFBR1P36897 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms