Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ITGA3P26006 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms