Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CTSSP25774 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTSSP25774 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTSSP25774 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTSSP25774 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTSSP25774 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CTSSP25774 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTSSP25774 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTSSP25774 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CTSSP25774 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CTSSP25774 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTSSP25774 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CTSSP25774 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CTSSP25774 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CTSSP25774 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CTSSP25774 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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CTSSP25774 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CTSSP25774 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTSSP25774 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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CTSSP25774 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTSSP25774 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTSSP25774 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTSSP25774 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTSSP25774 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTSSP25774 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTSSP25774 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTSSP25774 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CTSSP25774 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTSSP25774 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTSSP25774 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTSSP25774 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTSSP25774 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTSSP25774 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CTSSP25774 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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