Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
USF1P22415 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
USF1P22415 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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