Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF4P18085 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF4P18085 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF4P18085 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF4P18085 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF4P18085 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF4P18085 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF4P18085 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms