Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LYL1P12980 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYL1P12980 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYL1P12980 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms