Protein–RNA interactions for Protein: A8MVA2

KRTAP9-6, Keratin-associated protein 9-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-6A8MVA2 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 YWHAB-201ENST00000353703 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP9-6A8MVA2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms