Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CNTN3Q9P232 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTN3Q9P232 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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