Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms