Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
FOXQ1Q9C009 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms