Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HIRIP3Q9BW71 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms