Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL2

USP45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45Q70EL2 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP45Q70EL2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms