Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TDRD12Q587J7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms