Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PKDCCQ504Y2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PKDCCQ504Y2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms