Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXL1Q12952 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
FOXL1Q12952 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms