Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
SYCNQ0VAF6 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms