Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MANFP55145 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MANFP55145 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MANFP55145 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MANFP55145 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MANFP55145 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MANFP55145 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MANFP55145 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MANFP55145 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MANFP55145 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
MANFP55145 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms