Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DAP3P51398 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DAP3P51398 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DAP3P51398 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms