Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MRE11P49959 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRE11P49959 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MRE11P49959 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MRE11P49959 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms