Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPOP42166 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMPOP42166 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMPOP42166 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms