Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms