Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CD28P10747 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CD28P10747 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CD28P10747 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms