Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
F13BP05160 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
F13BP05160 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
F13BP05160 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
F13BP05160 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
F13BP05160 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F13BP05160 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F13BP05160 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F13BP05160 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F13BP05160 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
F13BP05160 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F13BP05160 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F13BP05160 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F13BP05160 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
F13BP05160 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms