Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TO15178 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TO15178 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TO15178 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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