Protein–RNA interactions for Protein: C9JTQ0

ANKRD63, Ankyrin repeat domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD63C9JTQ0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD63C9JTQ0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms