Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ARL2-SNX15V9GYD0 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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