Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9Y3F1 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9Y3F1 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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