Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC103724.2-201ENST00000520355 476 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC180Q9P1Z9 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms