Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SMIM2Q9BVW6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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