Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRNP3Q8WYN3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRNP3Q8WYN3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms