Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms