Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF2Q5BJF6 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ODF2Q5BJF6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms