Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC93Q567U6 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms