Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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IMPG1Q17R60 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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IMPG1Q17R60 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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IMPG1Q17R60 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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IMPG1Q17R60 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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IMPG1Q17R60 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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IMPG1Q17R60 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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IMPG1Q17R60 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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IMPG1Q17R60 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
IMPG1Q17R60 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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